Francis West Lewis医生在访问了伦敦大奥蒙德街儿童医院后，决定在美国创建一个专门为儿童看病的医院。他说服两位朋友—— T.Hewson Bache和R.A.F. Penrose——投身到这项事业当中。成立的第一年，医院仅有12张床和一个药房，接收了67个住院病人和306个门诊病人。在过去的几年，费城儿童医院增设了费城儿童医院研究院这个美国最大的儿科研究机构。此外，医院还并购了一家综合儿童康复中Children's Seashore House。费城儿童医院建立了目前美国最大的儿童医疗网络，涵盖50个站点，给整个宾夕法尼亚和新泽西的儿童提供医疗服务。费城儿童医院拥有527个床位。2012年接收的门诊和住院病人数超过100多万人次。

费城儿童医院在2013-14年《美国新闻和世界报道》儿童医院综合总排名中位列第一，这是该医院连续第3年荣登榜首。费城儿童医院不仅综合排名排在榜首，更在所有10个专科中都位居前四：
癌症中心在《美国新闻和世界报道》儿童癌症排行榜上排名第三。
肺科在《美国新闻和世界报道》排行榜上排名第一。
心脏中心在《美国新闻和世界报道》儿童心脏治疗排行榜上排名第二。
糖尿病和内分泌中心在《美国新闻和世界报道》儿童糖尿病内分泌治疗排行榜上排名第二。
泌尿科在《美国新闻和世界报道》排行榜上排名第一。
骨外科在《美国新闻和世界报道》排行榜上排名第二。

癌症中心- 费城儿童医院癌症中心在《美国新闻和世界报道》儿童癌症排行榜上排名第三。在费城儿童医院，国际知名的儿童肿瘤医生和擅长治疗某一癌症的临床小组一起，为癌症病人提供诊断和治疗。并且，在费城儿童医院，这些诊断及治疗都是遵循循证医学方法得出的。费城儿童医院的儿童癌症治疗中心项目范围广泛，包括：血液和骨髓移植项目、遗传性癌症易感体质项目、白血病和淋巴瘤项目、神经肿瘤项目、难治性神经母细胞瘤项目、复发白血病和淋巴瘤项目、实体瘤项目、肿瘤外科、癌症患者生存项目。创新突破（临床实验）主要包括：T细胞疗法治疗某些特定类型的儿童白血病和淋巴瘤；新型治疗方法用于治疗某些由基因变异造成的癌症。
肺内科 费城儿童医院肺科荣登《美国新闻和世界报道》2013-14肺科排行榜的第一名。该科可治疗的呼吸道疾病包括：哮喘、支气管发育不良(BPD)、儿童间质性肺疾病、慢性呼吸衰竭/呼吸功能不全、先天性肺异常、肺囊性纤维化、神经肌肉呼吸道疾病、小儿肺移植、原发性纤毛运动障碍(PCD)、肺睡眠障碍。肺内科的睡眠中心提供诊断服务，用于评估睡眠中的呼吸道障碍、行为障碍（比如睡前挣扎和夜间醒来）异态睡眠（比如梦游症和睡惊症）、发作性嗜睡病、昼夜节律睡眠障碍（比如睡眠相位后移症候群）和运动障碍（比如周期性肢体抽动障碍和疯狂摆头）进行评估。肺内科的胸廓发育不良综合征中心，对具有复杂脊柱侧凸和复杂胸椎疾病的患者进行评估、诊断和治疗。
糖尿病和内分泌中心-费城儿童医院糖尿病和内分泌中心在《美国新闻和世界报道》儿童糖尿病内分泌治疗排行榜上排名第二。费城儿童医院儿童糖尿病中心（DCC）是美国最大的专门治疗和研究儿童糖尿病的中心。胰岛素泵的使用和连续葡萄糖监测技术方面是由费城儿童医院儿童糖尿病中心首先发起适用推广的。在费城儿童医院内分泌和糖尿病科，医生可以评估和治疗多种疾病，包括甲状腺异常、肾上腺异常、脑垂体异常、性成熟异常和钙调节异常等。此外，费城儿童医院内分泌和糖尿病科还治疗能引起低血糖的糖原贮积病和脂肪酸代谢异常等。
泌尿科-费城儿童医院泌尿科在小儿泌尿专科领域处于世界领先水平。在《美国新闻和世界报道》“2012-13美国最佳儿童医院”的排名中，费城儿童医院泌尿科因擅长治疗处理复杂的儿童泌尿疾病，而被评选为全美小儿泌尿专科第一。泌尿科的治疗团队由领先世界的专家组成，据盛诺一家介绍，费城儿童医院的泌尿科擅长微创手术、泌尿生殖器重建、性发育疾病的综合治疗、神经性膀胱功能异常的治疗、肾结石和排尿功能紊乱的治疗。泌尿科的医生为患者提供各种手术方法，包括腹腔镜术、机器人手术和开放手术。费城儿童医院泌尿科的研究方向包括：由子宫内阻塞引起的膀胱损伤的治疗、生殖器伤口愈合、膀胱输尿管返流、性发育异常、微创手术、肾结石疾病、隐睾症患儿的生殖功能改善等。
神经内科-费城儿童医院神经科在小儿神经系统疾病领域处于世界领先地位。经过高级培训的神经科医师具有丰富的儿童神经系统疾病治疗经验，他们可治疗儿童脑卒中、癫痫、神经肌肉疾病、睡眠障碍、发育迟滞、神经遗传疾病、多发性硬化症、新生儿神经疾病等等。作为全美最大、最全面的神经专科之一，费城儿童医院神经科为患者及其家属提供全方位服务。神经科每年接诊的门诊量超过了17000人次。